Nguyên nhân chính dẫn đến bệnh thối nhũn trên cây rau cải là do sự xâm nhập và phát triển của các loại nấm đất như Pythium sp., Rhizoctonia solani, Sclerotium sp. và Fusarium sp. Trong điều kiện thời tiết ẩm ướt và nhiệt độ phù hợp, các bào tử nấm có khả năng nảy mầm và xâm nhập vào các mô non của rễ và thân cây. Khi đã xâm nhập, các sợi nấm sẽ phát triển nhanh chóng và tiết ra các enzyme phân giải mô cây. Điều này dẫn tới các triệu chứng thối ở rễ và gây chết cây. Đất có nhiễm bệnh từ vụ trước cũng là nguồn lây nhiễm quan trọng. Vì vậy, khử trùng đất và thực hiện các biện pháp phòng trừ là rất cần thiết để ngăn chặn gây hại của bệnh.
Rau, bí, cà tím, ớt, hành, hoa
Nấm Rhizoctonia solani phát triển mạnh trong điều kiện đất ẩm, nhiệt độ 20-30 độ C. Nấm sống ký sinh hoặc saprophyte trong đất và trên các mảnh vụn thực vật. Khi gặp điều kiện thuận lợi, bào tử nấm nảy mầm và tấn công vào rễ và gốc non của cây con ngay sau khi trồng. Đất và không khí ẩm là điều kiện lý tưởng để nấm phát triển, đặc biệt sau cơn mưa hay tưới tiêu là thời điểm dễ bị lây nhiễm. Mật độ trồng quá dày cũng khiến môi trường đất ẩm ướt, tạo điều kiện cho bệnh phát triển. Ngoài ra, việc sử dụng giống kém chất lượng, không quan tâm làm đất và bón phân cân đối cũng góp phần làm tăng nguy cơ bùng phát dịch bệnh chết cây con.
Nguyên nhân chính gây bệnh héo rũ trên cây rau màu là do nấm Fusarium xâm nhập. Nguồn lây lan chủ yếu của bệnh là từ đất và hạt giống bị nhiễm bệnh. Nấm Fusarium có thể tồn tại dai dẳng dưới dạng bào tử trong đất hoặc trên thực vật dại, rơm rạ và phế phẩm nông nghiệp trong nhiều năm. Khi gặp điều kiện thuận lợi như độ ẩm cao, nấm nảy mầm và lây sang cây trồng gần đó. Ngoài ra, việc sử dụng hạt giống bị nhiễm bệnh cũng khiến dịch bệnh lây lan rộng rãi và nhanh chóng ra diện rộng. Để phòng trừ, cần khử trùng đất, sử dụng hạt giống sạch bệnh và áp dụng các biện pháp canh tác hợp lý.
Nguyên nhân chính dẫn đến bùng phát bệnh thán thư do nấm Colletotrichum spp là do sự kết hợp của các yếu tố. Thứ nhất, điều kiện thời tiết ấm và độ ẩm cao rất thuận lợi cho sự phát triển của nấm. Ngoài ra, việc canh tác không hợp lý như thiếu vệ sinh đồng ruộng, không luân canh cây trồng đúng cách cũng khiến bệnh dễ bùng phát. Bên cạnh đó, sự suy giảm sức đề kháng do sâu bệnh tấn công làm cây yếu cũng là nguyên nhân chính. Mật độ gieo trồng quá dày, dinh dưỡng không cân đối và việc sử dụng thuốc bảo vệ thực vật không đúng liều lượng, cách quản lý cũng đóng vai trò quan trọng.