Nguyên nhân chủ yếu dẫn đến bệnh thối hoa do nấm Fusarium sp là do sự kết hợp của điều kiện thời tiết ẩm ướt và việc thực hiện không đúng kỹ thuật canh tác. Đặc biệt, thời điểm hoa nở rộ của cây sầu riêng trùng với mùa mưa, độ ẩm cao khiến môi trường lý tưởng cho nấm phát triển. Bên cạnh đó, việc tưới nước sai cách dẫn đến đọng đủ ẩm dài ngày trên bông hoa cũng là nguyên nhân khiến bệnh phát sinh và lây lan. Mật độ trồng quá dày, tán cây che kín cản trở sự thông thoáng cũng góp phần không nhỏ cho sự bùng phát của bệnh. Do vậy, cần phải thực hiện đúng kỹ thuật và phòng trừ bệnh kịp thời để hạn chế thiệt hại.
Sầu riêng
Nguyên nhân chính dẫn đến bệnh thối gốc chảy nhựa trên cây sầu riêng là do nấm Phytophthora palmivora. Nấm này phát triển mạnh trong điều kiện ẩm ướt, đất bị ngập nước. Môi trường này giúp nó dễ dàng xâm nhập, phát triển và lây lan sang các cây xung quanh. Ngoài ra, việc canh tác không đúng kỹ thuật như bón phân không cân đối, sử dụng giống không phù hợp cũng khiến cây sầu riêng dễ bị nhiễm bệnh. Vết thương trên cây do sâu bệnh hay thời tiết khắc nghiệt cũng là cửa ngõ để nấm xâm nhập. Nói chung, sự phát triển của bệnh thối gốc chảy nhựa có liên quan mật thiết tới các yếu tố về thời tiết, môi trường và quá trình chăm sóc cây trồng.
Nguyên nhân gây bệnh thán thư do nấm Colletotrichum gloeosporioides là do sự tác hợp của một số yếu tố sau: